Ô nhiễm nguồn nước tại nhiều lưu vực không còn mang tính nhất thời mà có xu hướng kéo dài, tái diễn theo mùa, nhất là khi dòng chảy suy giảm. Thực tế này đặt ra yêu cầu chuyển từ tư duy xử lý sự cố sang quản lý theo kịch bản, trong đó phải chủ động dự báo, kiểm soát nguồn thải, điều tiết dòng chảy và xác định rõ trách nhiệm, nguồn lực, thời hạn phục hồi đối với từng nguồn nước suy thoái.