Ngoài việc kiến nghị Bộ Tài nguyên-Môi trường xử lý nghiêm cán bộ cố tình đùn đẩy, né tránh trách nhiệm; có hành vi nhũng nhiễu, tiêu cực, gây phiền hà cho người dân và doanh nghiệp, Thanh tra Chính Phủ còn chỉ ra những vi phạm của Cục Khoáng sản Việt Nam thuộc Bộ TN- MT trong việc nhiều lần cấp giấy phép cho một số doanh nghiệp khai thác khoáng sản không đúng nghị định của Chính phủ và vi phạm Luật Khoáng sản.