Nhà chức trách đã phát cảnh báo khẩn cấp cấp độ 5 - mức cao nhất hiếm khi được đưa ra - vào khoảng 8h sáng 29/8 (giờ địa phương) đối với thành phố Yufu thuộc tỉnh Oita trên đảo chính Kyushu khi bão Shanshan đổ bộ làm nước sông Miyakawa tràn bờ trong mưa lớn.