Theo đó, mục tiêu của Chương trình Ngày hội Khoa học là xây dựng các hoạt động tương tác để giúp các em học sinh không chỉ tham gia thực hành để hiểu biết về nguyên lý mà thông qua đó sẽ hiểu hơn về mối tương quan giữa Hiện tượng – Khoa học – Cuộc sống. Hoạt động của chương trình sẽ được thiết kế dưới dạng các bài học thực hành, những thí nghiệm, hay các trò chơi, robot… liên quan đến cả khoa học tự nhiên và khoa học xã hội.