Theo đó, UBND huyện Chương Mỹ xác định Công ty Cổ phần Hà Nội Foods Việt Nam đã vi phạm các quy định về xả nước thải có chứa các thông số môi trường thông thường vào môi trường cụ thể: Xả nước thải vượt quy chuẩn kỹ thuật về chất thải từ 5 lần đến dưới 10 lần, thông số Coloform vượt quy chuẩn cho phép 8,6 lần trong trường hợp thải lượng nước thải nhỏ hơn 0,5m3/ngày; Xả nước thải vượt quy chuẩn kỹ thuật về chất thải từ 1,1 đến 1,5 lần, thông số BOD5 (20C) vượt 1,2 lần; COD vượt 1,43 lần; Xả nước thải vượt quy chuẩn kỹ thuật về chất thải từ 1.5 đến dưới 2 lần, thông số Amoni (NH4+-N) vượt 1,75 lần.
Với vi phạm này, UBND huyện Chương Mỹ xử phạt Công ty Cổ phần Hà Nội Foods Việt Nam số tiền 70 triệu đồng và yêu cầu phải thực hiện các biện pháp khắc phục tình trạng ô nhiễm môi trường và báo cáo kết quả đã khắc phục xong hậu quả vi phạm, rà soát, cải tạo công trình xử lý nước thải đáp ứng yêu cầu kỹ thuật về bảo vệ môi trường.
Trước đó, những người dân sống tại thôn Phương Bản, xã Phụng Châu đã liên tục gửi đơn kiến nghị đến các cơ quan chức năng phản ánh về việc Công ty Cổ phần Hà Nội Foods Việt Nam trong quá trình sản xuất đã liên tục gây ô nhiễm môi trường nước, gây tiếng ồn, chất thải của công ty bốc mùi hôi thối.
Ông Hoàng Tiến H., người dân sống tại xã Phụng Châu cho biết: Từ ngày Công ty Cổ phần Hà Nội Foods Việt Nam chuyển về đây, người dân chúng tôi luôn phải sống trong cảnh ô nhiễm, mùi hôi thối từ chất thải của nhà máy thải ra tanh nồng nặc cùng với đó là tiếng ồn máy móc phát ra từ cơ sở chế biến của Công ty khiến đời sống của những người dân xung quanh đây ảnh hưởng nghiêm trọng.
Ông Vương Danh Quang - Chủ tịch UBND xã Phụng Châu cho biết: Đợt tiếp xúc cử tri vừa qua, người dân tại thôn Phương Bản có kiến nghị rất nhiều về việc Công ty Cổ phần Hà Nội Foods Việt Nam gây ô nhiễm môi trường nên UBND xã Phụng Châu đã gửi văn bản kiến nghị lên UBND huyện.
Sau đó, UBND huyện đã cho thành lập đoàn kiểm tra gồm Phòng TNMT huyện, Công an kinh tế xuống địa bàn lấy mẫu xét nghiệm cho thấy họ có những thông số vượt quy chuẩn rồi mới ra quyết định xử phạt.
Vào năm 2020 Công ty Cổ phần Hà Nội Foods Việt Nam có cơ sở tại KĐT Văn Phú, quận Hà Đông cũng từng bị UBND quận Hà Đông ra quyết định xử phạt 60 triệu đồng về hành vi xả thải gây ô nhiễm môi trường.