Ngành chăn nuôi ở tỉnh Kon Tum có nhiều chuyển biến rõ nét về tổ chức sản xuất, quy mô trang trại theo hướng khép kín, an toàn sinh học, ứng dụng công nghệ cao. Tỷ trọng của ngành này cũng có xu hướng tăng trong tổng giá trị sản xuất của ngành nông nghiệp trên địa bàn. Tuy nhiên, chăn nuôi trên địa bàn tỉnh vẫn còn tồn tại nhiều khó khăn, một trong số đó chính là việc phát triển chăn nuôi gắn với bảo vệ môi trường.